Une nouvelle recherche de l’Université de Géorgie a montré, pour la première fois, que les composés utilisés pour lutter contre les maladies fongiques des plantes provoquent une résistance aux médicaments antifongiques utilisés pour traiter les personnes.
L’étude s’est concentrée sur Aspergillus fumigatus, le champignon qui cause aspergillose, une maladie qui provoque chaque année des infections potentiellement mortelles chez 300 000 personnes dans le monde. Publié dans G3 : Gènes, Génomes, Génétique, la étudier lié l’utilisation agricole des azoles – composés utilisés pour lutter contre les maladies fongiques des plantes – à une efficacité réduite des azoles cliniques utilisés pour traiter les infections fongiques chez les patients.
Une illustration médicale d’un champignon résistant aux azoles, Aspergillus fumigatus. Crédit image : CDC
« Nos résultats montrent que la résistance aux composés utilisés pour combattre les infections fongiques chez l’homme se développe dans les environnements agricoles », a déclaré Marin T. Brewer, auteur correspondant de l’étude et professeur agrégé de mycologie au Collège des sciences agricoles et environnementales. « Les échantillons que nous avons collectés en milieu agricole étaient résistants à la fois aux azoles utilisés dans l’environnement et aux azoles cliniques utilisés pour traiter les personnes. »
Les champignons résistants aux traitements sont répandus dans l’industrie agricole
Les champignons peuvent être une menace pour les humains et les plantes, causant plus de 1,5 million de décès humains par an et des pertes de récoltes de 20 %.
Il n’est pas rare de trouver A. fumigatus dans l’environnement. C’est aérien, et c’est partout. La plupart des gens le respirent sans problème, mais il peut provoquer de graves infections chez les personnes dont le système immunitaire est affaibli.
Lorsqu’ils sont infectés par une souche de champignon résistante aux fongicides azolés agricoles, les médicaments azolés cliniques utilisés dans les soins de santé sont également inefficaces.
« Azole-résistant A. fumigatus est répandu dans les environnements agricoles et en particulier dans des choses comme le compost », a déclaré Michelle Momany, auteur correspondant de l’étude et professeur de biologie fongique au Département de biologie végétale du Collège Franklin des arts et des sciences. « Une personne immunodéprimée et à risque d’infections fongiques doit être très prudente dans ces contextes. »
Souches de champignons résistantes aux traitements dans les fermes étroitement liées à celles des hôpitaux
Brewer et Momany, tous deux membres de Groupe interdisciplinaire de biologie fongique de l’UGA a dirigé une équipe qui a collecté des échantillons de sol, de matériel végétal et de compost sur 56 sites en Géorgie et en Floride. La plupart des sites avaient récemment été traités avec un mélange de fongicides comprenant des azoles et d’autres fongicides qui ne sont utilisés qu’en agriculture, pas chez les patients. Mais deux des sites étaient biologiques et n’avaient pas utilisé de fongicides depuis plus d’une décennie.
Après avoir récupéré des souches d’A. fumigatus, les chercheurs en ont trouvé 12 très résistantes aux azoles utilisés en agriculture et en médecine. Les 12 souches présentaient également des niveaux élevés de résistance à deux fongicides non azolés qui ne sont pas utilisés pour traiter les humains.
Les chercheurs ont utilisé le séquençage du génome entier pour créer un arbre généalogique génétique des souches d’A. fumigatus provenant de l’environnement et des patients. Ils ont découvert que les mécanismes de résistance aux azoles qu’ils avaient identifiés dans les souches provenant des milieux agricoles correspondaient à ce qu’ils avaient observé chez les patients. Les souches résistantes aux azoles provenant de patients étaient également résistantes aux fongicides non azolés qui ne sont jamais utilisés chez l’homme, ce qui montre que ces souches se trouvaient dans des environnements agricoles avant que les patients ne soient infectés.
« Les souches qui proviennent de l’environnement et des personnes sont très étroitement liées les unes aux autres », a déclaré Brewer. « Ce n’est pas comme si différentes souches développaient une résistance chez les personnes et dans l’environnement. C’est tout pareil. Ainsi, les personnes qui ont ces infections résistantes les ont probablement acquises dans l’environnement.
Besoin désespéré de nouveaux fongicides respectueux de l’environnement
Sur les 25 souches résistantes aux multiazoles incluses dans l’étude, huit provenant de milieux agricoles et 12 de patients étaient également résistantes aux fongicides agricoles non azolés. Ces souches multi-résistantes aux fongicides provenaient de milieux agricoles aux États-Unis et d’Inde et de milieux cliniques aux États-Unis, aux Pays-Bas et en Inde.
« Cette émergence limite considérablement l’utilité des fongicides pour gérer les agents pathogènes des plantes tout en préservant l’utilité clinique des azoles », a déclaré Brewer. « Nous avons un besoin urgent de fongicides agricoles efficaces qui ne sont pas toxiques pour l’environnement et qui n’entraînent pas le développement rapide d’une résistance généralisée dans la clinique. »
La source: Université de Géorgie
