La Terre contient environ mille milliards d’espèces de microbes, dont seulement un dixième environ a été identifié. Un humain peut abriter 100 000 milliards de microbes, créant un microbiome qui sert un écosystème de microbes.
Les microbes se connectent et se transforment de multiples façons, créant, combinant et séparant à nouveau les microbiomes. Comment les scientifiques peuvent-ils commencer à analyser comment les microbiomes diffèrent, comment ils sont similaires, comment ils ont évolué et comment ils peuvent changer à l’avenir ?
Graphique montrant un réseau mondial de transition du microbiome. Crédit image : Liu Yang et Jing Gongchao
Financé par la National Science Foundation des États-Unis les chercheurs peuvent avoir une réponse. Ils ont publié un réseau basé sur la recherche entièrement connecté et sans échelle pour explorer la connectivité des microbiomes à travers le monde dansmSystèmes.
Pour mieux comprendre comment le grand nombre d’espèces microbiennes variées a évolué, les scientifiques ont utilisé un Moteur de recherche sur le microbiome pour construire un réseau mondial de transition du microbiome, ou MTN, qui relie, en fonction de leurs similitudes de composition, 177 022 microbiomes de 20 écosystèmes divers qui incluent la pléthore de niches écologiques dans le corps humain et l’environnement.
Le MTN mondial est sans échelle, ce qui est similaire à Internet ou aux réseaux sociaux entre individus humains. Dans ces types de réseaux, la plupart des nœuds sont chacun connectés à un petit nombre d’autres nœuds, mais une petite partie des nœuds est connectée à de nombreux autres.
Les informations du MTN mondial peuvent fournir des informations importantes, telles que l’évolution ou l’interaction des microbiomes. Par exemple, la feuille de route a révélé que les océans sont les microbiomes les plus susceptibles d’interagir avec le sable des plages et les poissons marins, tandis que le sol et l’eau douce sont les portes d’échange microbien entre l’environnement et les plantes ou les humains.
Avec les changements rapides du climat, de nombreux microbiomes disparaissent et émergent chaque jour. La construction et la mise à jour du MTN mondial seraient impossibles sans de puissants moteurs de recherche et des bases de données standardisées pour les microbiomes, telles que celles du moteur de recherche du microbiome.
La source: NSF
